Le Comité gouvernemental de la HES-SO constitue l’organe de pilotage stratégique de l’institution. Il réunit les conseillères et conseillers d’État en charge de la formation des cantons partenaires de la HES-SO. Sa présidence est assurée à tour de rôle, pour une durée de deux ans, par l’une ou l’un de ses membres.
Dès le 1er juillet 2026, la représentation du Comité gouvernemental de la HES-SO sera composée de Anne Hiltpold (Genève), Olivier Curty (Fribourg), Frédéric Borloz (Vaud), Christophe Darbellay (Valais), Crystel Graf (Neuchâtel, représentante de la région Arc / Berne, Jura, Neuchâtel).